La Comisión de Coordinación Pedagógica es el órgano que asesora al Jefe de Estudios en el ejercicio de sus funciones y promueve la coordinación y la calidad de los procesos de enseñanza y aprendizaje del Centro de acuerdo con el Paradigma Ignaciano y los objetivos y líneas educativas propuestos por los Documentos institucionales de la Compañía. Se reúne con una periodicidad semanal.

Está presidida por el Jefe de Estudios y la compo­nen los Jefes de Departamento o Seminario. Los miembros de la Comisión de Coordinación Pedagógica lo serán mientras duren sus cargos. Asisten, además, el Coordinador General de Formación, el Coordinador General de Pastoral,los Di­rectores de Etapa o Ciclo y el Jefe de Departamento de Orientación para una mayor coordinación educativa.